Начальник факультета: Ковалев Сергей Евгеньевич, доктор транспорта, Заслуженный военный специалист, Почетный работник транспорта России, профессор

Факультет военного обучения (ФВО) основан на базе военной кафедры. которая была создана одновременно с открытием ВАУ ГВФ в 1955 году.
Студентам, прошедшим обучение по программам подготовки офицеров запаса на ФВО, после окончания Академии присваивается воинское звание лейтенант запаса, и они могут проходить службу в подразделениях и частях ВВС, авиации ВМФ других министерств и ведомств на первичных должностях офицеров боевого управления, штурмана экипажа(корабля), помощника командира экипажа (правого летчика).

Кроме того, выпускников ФВО могут привлекаться к службе в центрах единой системы организации воздушного движения, в учебных заведениях и в штабах войсковых частей Министерства обороны РФ.
На факультете имеются три военные кафедры: штурманской подготовки; летной эксплуатации; боевого управления авиацией.

Факультет готовит офицеров запаса по специальностям:
ВУС 061905 “Штурманская, транспортной авиации (турбо-винтовые и реактивные самолеты)”;
ВУС 061401 “Применение подразделений, частей и соединений военно-транспортной авиации (турбовинтовые и реактивные самолеты)”;
ВУС 062701 “Боевое управление полетами авиации с наземных пунктов управления, имеющих системы наведения”.